准噶尔和大清为敌，主要是噶尔丹野心太大。明清时，卫拉特蒙古分四部，准噶尔最有野心。1671 年噶尔丹掌权后，搞文字改革、定法律、推行集权，把松散部落变成汗国。1678 年，他南下拿下叶尔羌汗国，西征哈萨克。
噶尔丹去世后，策妄阿拉布坦继位，1717 年准军攻入西藏。此后准噶尔不断挑衅，雍正曾派军征讨，虽有胜负但最终议和。1745 年噶尔丹策零死后，准噶尔内乱，贵族争权，不少部落归附清朝。乾隆出兵消灭割据政权，可阿睦尔撒纳归附后又反叛。准噶尔的野心和不断挑衅，让清朝花七十年死磕，最后走向灭族。