今天给大家推荐一个很好用的数据库,❗️只要你输入蛋白名称或者id号,目前这个蛋白有的功能,和谁互作,细胞定位,修饰,表达情况,突变情况,结构域有哪些等等等等,都就查到了,相关信息的代表文献都在后面列出来了我们可以直接查看原文章。 这样我们就能了解个大概,不用pubmed一篇一篇文献去查了,如果想看具体文献也可以去看。
刚接触一个蛋白想要初步了解的宝贝
写综述的宝贝
做生信分析的宝贝
做ppt汇报背景介绍的宝贝
基本就是所有做蛋白的研究生都适用,无论你是什么需求。
Uniprot :是包含蛋白质序列,功能信息,研究论文索引的蛋白质数据库,整合了EBI,SIB,PIR三大数据库的资源。(自己了解,这里不介绍)
👾查一个蛋白信息的基本操作(图上教学)
✅过滤选项面板里的一些小点:
来源库:Reviewed:存储在Swiss-Prot数据库中经过验证的蛋白数据。
Unreviewed:存储在TrEMBL数据库中没有经过验证的蛋白数据。
物种,点击Popular organisms切换到该物种,或者在 Taxonomy通过 taxid 来筛选。
蛋白质相关注释内容:直接点击对应键字
注释分数:分数越高,注释内容质量越高
蛋白质长度:单位是氨
✅搜索结果表
依次是Unprot ID,蛋白质Uniprot名称,蛋白质名称,基因名,物种名,序列长
✅比对操作
序列与蛋白库比对:如果需要Blast来查看某个蛋白有哪些序列相似的蛋白序列,先选中感兴趣蛋白前的方框,点击Blast,多序列比对:先选中感兴趣蛋白前的方框,点击Align。







